医疗事故司法鉴定可以由依职权提起或由当事人书面申请，司法鉴定机构对医疗事故作出鉴定后，出具司法鉴定文书。医疗事故司法鉴定程序：
1、委托
司法鉴定机构和社会专业司法鉴定人接受司法机关的委托，从事委托请求事项的司法鉴定；非诉讼案件鉴定的受托从其行业规定。
2、受理
司法鉴定机构收到委托书后，应对委托人的委托事项进行审核。
3、初次鉴定
鉴定机构受理案件后，应当指派具有社会专业司法鉴定资格的人员承担鉴定工作，同一鉴定事项应当由两名具有社会专业司法鉴定资格的人员进行。
4、补充鉴定
司法鉴定机构接受委托进行补充鉴定，应当对委托人请求的事项进行审查，不属《司法鉴定程序通则》第三十条规定的情形，社会专业司法鉴定机构应当向委托人说明情况，并退回委托书。
补充鉴定符合《司法鉴定程序通则》第三十一条规定的情形，社会专业司法鉴定机构可以指定原鉴定人进行，也可以指派其他社会专业司法鉴定人进行，补充鉴定文书是原鉴定文书的组成部分。有下列情形之一的，司法鉴定机构可以接受委托，进行补充鉴定：
(1)发现新的相关鉴定材料；
(2)原鉴定项目有遗漏。
5、重新鉴定
对重新鉴定，专业司法鉴定机构应当要求委托人提供与原鉴定材料相同的材料。重新鉴定仍在原社会专业司法鉴定机构进行的，不能由原鉴定人承办重新鉴定的事项。有下列情形之一的，司法鉴定机构可以接受委托，进行重新鉴定：
(1)司法鉴定机构、司法鉴定人超越司法鉴定业务范围或者执业类别进行鉴定的；
(2)送鉴的材料虚假或者失实的；
(3)原鉴定使用的标准、方法或者仪器设备不当，导致原鉴定结论不科学、不准确的；
(4)原鉴定结论与其他证据有矛盾的；
(5)原司法鉴定人应当回避而没有回避的；
(6)原司法鉴定人因过错出具错误鉴定结论的；
6、复核鉴定。
7、司法鉴定文书的出具。
