不一样。
就业证明是让单位出具一份你已经就业的文件，是一个证明信，没有任何的法律效率和程序。而三方协议就是你在没有毕业之前找到正式的工作单位签订的预备就业协议，由于此时你的身份还是学生，所以学校有监管义务，就变成了毕业生本人、学校、用人单位三方的协议。
三方协议是《普通高等学校毕业生、毕业研究生就业协议书》的简称，它是明确毕业生、用人单位、学校三方在毕业生就业工作中的权利和义务的书面表现形式，能解决应届生毕业生户籍、档案、保险、公积金等一系列相关问题。协议在毕业生到单位报道（凭《全国普通高等学校本专科毕业生就业报到证》或《全国毕业生研究生报到证》）、用人单位正式接收后自行终止。
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【本文所涉及的法律依据】：：
《普通高等学校毕业生就业工作暂行规定》
第二十四条
经供需见面和双向选择后，毕业生、用人单位和高等学校应当签订毕业生就业协议书，作为制定就业计划和派遣的依据。未经学校同意，毕业生擅自签订的协议无效。
