借款合同两万元违约金一万元是合法的，但前提是双方当事人在签订合同之前就约定好了的。借款违约金数额约定是双方真实意思表示的，通常都是合法的，但是一般不得超过违约造成损失的30％。
根据实施的《民法典》第五百八十五条规定，当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。
约定的违约金低于造成的损失的，人民或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以增加；约定的违约金过分高于造成的损失的，人民或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当减少。
当事人就迟延履行约定违约金的，违约方支付违约金后，还应当履行债务。
法律依据：
《民法典》第五百八十五条
当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。
约定的违约金低于造成的损失的，人民或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以增加；约定的违约金过分高于造成的损失的，人民或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当减少。
当事人就迟延履行约定违约金的，违约方支付违约金后，还应当履行债务。
一、违约金不支付会怎么样？
对于迟延履行的，违约方支付违约金后，守约方仍可以要求其继续履行合同。对于其他违约行为，违约方支付违约金（或者赔偿损失）后，不需要再继续履行合同。如守约方起诉，将面临败诉的风险。建议和对方协商，可放弃押金，协议解除合同，减少损失。
二、对方不支付违约金怎么办？
违约方拒付违约金的，主要有以下几种索偿方法：
违约方拒付违约金的，可以先协商解决；协商不成，可以通过至诉讼的方式进行维权索偿。
（一）协商解决：解决纠纷，能够协商解决当然最好，我们建议都尽量和气地，尽可能拿对方的利益来互相牵制，以达到和解的效果。
（二）起诉：
这是要着重介绍的一种索偿方法，因为受理之后的审判决定，具有法律强制力！
起诉首先要弄懂可以去哪个起诉。
合同纠纷，确定起诉的几个方法：
1、合同有约定管辖的，以合同约定的为准。
2、合同没有约定管辖，或者约定不明的，在被告住所地或合同履行地起诉。
其中：
（1）争议标的为给付货币的，接收货币一方所在地为合同履行地；
（2）交付不动产的，不动产所在地为合同履行地；
（3）其他标的，履行义务一方所在地为合同履行地。
