根据我国法律的相关规定，伪造公文证件印章是刑事犯罪，属于刑事案件，而刑事案件的侦查除法律另有规定外，由机关进行。所以伪造公文证件印章的侦查由机关进行。
【本文关联的相关法律依据】
《中华人民共和国刑法》第二百八十条第一款伪造、变造、买卖或者盗窃、抢夺、毁灭国家机关的公文、证件、印章的，处三年以下有期徒刑、拘役、管制或者剥夺政治权利，并处罚金；情节严重的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金。
《中华人民共和国刑法》第二百八十条第二款伪造公司、企业、事业单位、人民团体的印章的，处三年以下有期徒刑、拘役、管制或者剥夺政治权利，并处罚金。
《中华人民共和国刑事诉讼法》第十九条第一款刑事案件的侦查由机关进行，法律另有规定的除外。
