NFS+MPICH2 简单集群搭建
准备工作：
Sudo apt-get install openssh-server( master node)
Sudo apt-get install openssh-client(slave node)
Sudo apt-get install nfs-kernel-server(master node)
Sudo apt-get install nfs-client(slave node)
Sudo apt-get install gcc (g++ gfortran 可选)
加上所有用户名都是（h）
NFS系统配置
1. master node
（1）用 命令sudo vi /etc/hostname 打开 hostname 文件， 将主机名改为自己想要的名字（如 node0）,保存退出vi编辑器，然后用命令sudo reboot重启， CTR+ALT+t 会在命令行窗口看到刚才改的名字；
（2）用命令 sudo vi /etc/hosts 打开hosts 文件，配置hosts文件（如下面形式（3个节点））
127.0.0.1 localhost
192.168.1.10 node0
192.168.1.11 node1
192.168.1.12 node2
注意：此时的node0 必须与第一步改的一样 否则启动不了mpich2）
（3）第一步，利用命令 cd / 回到根目录，然后 sudo mkdir cluster 创建 共享目录cluster。用ls –l 或者ll 查看刚建立的 cluster目录，其属于root用户和root组。用命令 sudo chown h:h /cluster进行修改，再次参考会发现 目录/cluster 已经被改成我们所想要的用户和组；第二步，用命令sudo vi /etc/exports（或者 sudo gedit /etc/exports）打开 exports 文件，并在文件末尾添加如下形式的东西
/cluster node0(rw,sync,fsid=0,crossmnt,no_subtree_check)
/cluster node1(rw,sync,fsid=0,crossmnt,no_subtree_check)
/cluster node2(rw,sync,fsid=0,crossmnt,no_subtree_check)
这两句的意思是说 将master node0 的/cluster 目录共享给node1，node2，权限是读和写
到此，master node 的NFS配置完毕。
最后，运行 sudo exportfs -rv 使配置生效。
2. slave nodes 配置（每个slave node）
（1）用 命令sudo vi /etc/hostname 打开 hostname 文件， 将主机名改为自己想要的名字（如 node0）,保存退出vi编辑器，然后用命令sudo reboot重启， CTR+ALT+t 会在命令行窗口看到刚才改的名字；
（2）用命令 sudo vi /etc/hosts 打开hosts 文件，配置hosts文件（如下面形式（3个节点））
127.0.0.1 localhost
192.168.1.10 node0
192.168.1.11 node1
192.168.1.12 node2
保存退出。
（3）挂载 master node 的 cluster目：用命令sudo vi /etc/fstab（或者 sudo gedit /etc/fstab）打开 fstab 文件，并在文件末尾添加如下形式的东西
node0：/cluster /cluster nfs rw, async,auto,exec,nouser,suid 0 0
保存退出。
节点之间的ssh 无密码登录
所有节点之间都执行相同的操作，在此以master node为例进行操作
注：ping node1( ping node2) 看是否都能ping通，否则检查硬件和自己的配置，直到所有节点都ping通之后再继续下面的操作
cd
ssh-keygen –t rsa 一路回车之后
cd .ssh (进入 .ssh 目录)
ls (会看到 有 id_rsa, id_rsa.pub 两个文件，分别表示公钥和私钥)
touch authorized_keys (创建空文件authorized_keys, 制作授权密钥)
cp id_rsa.pub ~/.ssh/authorized_keys
scp id_rsa.pub node1:~/.ssh/0.pub
scp id_rsa.pub node2:~/.ssh/0.pub
分别进入node1， node2 的.ssh目录执行
cat 0.pub >> authorized_keys
所有node 执行上面相同的操作之后，在每个节点分别执行
ssh node* ( * 可以代表0, 1, 2中的一个)，如果都不需要输入密码就能进入别的node则说明配置成功，否则检查，直到能无密码登录为止。
利用 exit退出登录。
（可能出错，出错时将 known-hosts 删除，重新执行（类似cat 0.pub >> authorized_keys
的语句，便可解决）
MPICH 2 安装及配置
安装：（master node）
sudo apt-get install build-essential
sudo apt-get install autoconf
sudo apt-get install automake
在mpi官网下载最新的mpich2，然后 利用 cp ~/Downloads mpich2-xxxx.tar.gz /cluster/
tar –xzvf mpich2-xxxx.tar.gz (解压缩)
sudo mkdir mpich2 (新建目 mpich2 用来安装mpich2)
cd /cluster/mpich2-xxxx
./configure –prefix=/cluster/mpich2 --with-pm=mpd (参考mpic2 用户手册 根据自己的需要进行配置)
配置完之后，运行
sudo make (需要几分钟时间)(反make： make clean)
完事之后，运行
sudo make install (需要几分钟时间)（反install： sudo make uninstall）
环境变量配置：（master node 和slave node节点相同部分）
cd (回到 ~/ 目录)
vi .bashrc (打开 .bashrc 文件，然后 在文件末尾添加如下内容)
export PATH=”/cluster/mpich2/bin: $PATH”
export PATH
export LD_LIBRARY_PATH=”/cluster/mpich2/lib:$ LD_LIBRARY_PATH”
export LD_LIBRARY_PATH
保存，退出，然后运行
source ~/.bashrc 加载修改的内容
对master node 还多下面一步
sudo vi /etc/environment
将PATH 的值修改为(使ssh能够找到)
修改前
PATH=”/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/sbin:/bin:/usr/games”
修改后
PATH=”/cluster/mpich2/bin:
/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/sbin:/bin:/usr/games”
要使mpich2能够运行还需要一下一些配置
master node
cd (回到 ~/ 目录)
touch mpd.hosts
vi mpd.hosts 添加如下内容，然后保存退出
node0
node1
node2
也可以以这种方式
node0:num0
node1:num1
node2:num2
其中，numi 为每个节点的cpu数
接着配置 .mpd.conf 文件（所有node）
cd (回到 ~/ 目录)
touch .mpd.conf
vi ~/.mpd.conf
添加 MPD_SECRETWORD=mypasswd. 其中mypasswd最好喝用户的密码保持一致
chmod 600 ~/.mpd.conf (修改权限)
到此所有配置全部完成
在个节点分别用一下命令进行测试，看是否配置成功
mpd &
mpdtrace
mpdallexit
若以上测试都成功，则可以回到master node 进行体验简单的并行程序
cd
mpdboot –n 3 –f mpd.hosts
mpirun -n 20 /cluster/mpich2-xxxx/examples/cpi
mpdallexit 完工
